硼在植物体内碳水化合物的运输起着重要的作用：
    硼能与植物体内富—OH基的化合物形成络合物。当硼和各种羟基化合物（包括碳水化合物糖）形成络合物时，这些络合物通过细胞膜的速度比中性糖分子要快。因此提供充足的硼元素可促进作物果实糖份的积累，提高果实的糖份含量。
1、硼能影响酚类化合物和木质素的生物合成
    缺硼能引起植物体酚类化合物的累积，这些累积的酚类化合物会引起组织坏死，甚至死亡；尤其双子叶植物比较明显。酚类化合物的累积还会引起木质素的累积。因此在一些作物缺硼的时候果实会发生木栓化，影响作物的产量和质量。
2、硼影响花粉萌发和花粉管的生长
    硼对于植物繁殖器官的发育具有重要的作用。植物的硼含量在花中最高；花中又以柱头、子房、雌雄蕊含硼量最高。因此，缺硼使植物生殖器官的形成受到障碍。如油菜的“花儿不实”，小麦的“穗而不实”，棉花的“蕾而不花”等。
3、硼能影响细胞分裂、分化和成熟
    植物缺硼导致分生组织的分化过程受到阻碍，缺硼症状往往首先在根尖和茎尖等生长点上反映出来。因此，缺硼植株顶端生长点受到破坏，植株矮小，腋芽大量生长，茎和叶柄开裂，整个植株呈簇状，植株缺硼导致一系列的生理变化和体内物质的增减，从而限制了细胞的分裂和成熟。
4、硼参于植物生长素类激素的代谢
    缺硼可以降低植物体内游离生长素的水平，使生长素含量增加。因此缺硼的许多症状与生长素浓度过高造成的症状很相似。硼对光合作用也有重要的影响，正常植物的叶绿体内硼的相对浓度较高，缺硼使叶绿体退化而影响光合作用。同时，硼能促进光合产物的运转，缺硼时减少植物新生组织得到光合产物，糖含量也下降。
    在硼缺乏的条件下，豆科作物的根瘤很难形成。因此硼缺乏抑制了氮的固定，减少了豆科作物的氮含量和土壤的氮含量。硼缺乏的植物更容易受到冻害（比如，紫花苜蓿，葡萄、柑橘、苹果、橄榄和多种林木作物），干旱（比如：苜蓿和玉米），和一些真菌疾病和侵害（比如，谷物、番茄、胡椒和卷心菜）。缺硼导致细胞壁抗逆性下降和糖份含量减少，硼缺乏的果实很难保存。